Theo Nghị định số 36/2020/NĐ-CP, những hành vi như không thực hiện chế độ báo cáo về hoạt động xả nước thải vào nguồn nước; không báo cáo kịp thời trong trường hợp có sự cố ô nhiễm nguồn nước do hành vi xả nước thải gây ra; không báo cáo trung thực, đầy đủ về hoạt động xả nước thải vào nguồn nước cho cơ quan có thẩm quyền thì bị phạt tiền từ 5 - 10 triệu đồng.

Một trong các hành vi vi phạm quy định của giấy phép xả nước thải vào nguồn nước sẽ bị phạt tiền từ 120 - 130 triệu đồng, như: Thu gom nước thải không đúng thiết kế theo quy định của giấy phép; vận hành hệ thống xử lý nước thải không đúng quy trình vận hành theo quy định của giấy phép; không chuẩn bị nhân lực, trang bị các phương tiện, thiết bị cần thiết để ứng phó, khắc phục sự cố gây ô nhiễm nguồn nước; tự ý cho tổ chức, cá nhân khác xả nước thải vào hệ thống thu gom, xử lý nước thải do mình đầu tư, quản lý, vận hành không đúng quy định của giấy phép.

Hành vi xả nước thải vào nguồn nước có hàm lượng chất ô nhiễm vượt quá giới hạn quy định trong giấy phép thì áp dụng xử phạt theo quy định về xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực bảo vệ môi trường, đồng thời áp dụng mức phạt tiền từ 10 - 15 triệu đồng, tước quyền sử dụng giấy phép xả nước thải vào nguồn nước trong thời hạn từ 3 - 6 tháng, buộc thực hiện các biện pháp khắc phục tình trạng ô nhiễm, suy thoái, cạn kiệt nguồn nước.